New insights into the mycobacterial PE and PPE proteins provide a framework for future research.

Wawasan baru mengenai protein PE dan PPE mikobakteri memberikan kerangka kerja bagi penelitian mendatang.

Mikobakteriyel PE ve PPE proteinlerine ilişkin yeni içgörüler, gelecekteki araştırmalar için bir çerçeve sunmaktadır.

Clicks: 502
ID: 92765
2020
Article Quality & Performance Metrics
Overall Quality
Not rated
Combines reader engagement with the AI quality analysis. This article has not been analysed, so there is no overall score — reader engagement is measured and shown alongside.
AI Quality Assessment
Not analyzed
Readership in this journal
Emerging

Ranked #2 of 28 articles by views in molecular microbiology

Most read Least read

Bar heights use a square-root scale.

Mint this article as an NFT
Not yet minted

Create a permanent, verifiable on-chain record of this article on the Scimatic Network. The NFT is held in your Journament account, and you can withdraw it to your own wallet at any time.

5 SUSD one-off · no wallet required
Sign in to mint
Abstract
The PE and PPE proteins of Mycobacterium tuberculosis have been studied with great interest since their discovery. Named after the conserved proline (P) and glutamic acid (E) residues in their N-terminal domains, these proteins are postulated to perform wide-ranging roles in virulence and immune modulation. However, technical challenges in studying these proteins and their encoding genes have hampered the elucidation of molecular mechanisms and leave many open questions regarding the biological functions mediated by these proteins. Here, I review the shared and unique characteristics of PE and PPE proteins from a molecular perspective linking this information to their functions in mycobacterial virulence. I discuss how the different subgroups (PE_PGRS, PPE-PPW, PPE-SVP and PPE-MPTR) are defined and why this classification of paramount importance to understand the PE and PPE proteins as individuals and or groups. The goal of this MicroReview is to summarize and structure the existing information on this gene family into a simplified framework of thinking about PE and PPE proteins and genes. Thereby, I hope to provide helpful starting points in studying these genes and proteins for researchers with different backgrounds. This has particular implications for the design and monitoring of novel vaccine candidates and in understanding the evolution of the M. tuberculosis complex.
Protein PE dan PPE dari *Mycobacterium tuberculosis* telah dipelajari dengan minat yang besar sejak pertama kali ditemukan. Dinamai berdasarkan residu prolin (P) dan asam glutamat (E) yang terkonservasi pada domain N-terminalnya, protein-protein ini dipostulatkan menjalankan berbagai peran dalam virulensi dan modulasi imun. Namun, tantangan teknis dalam mempelajari protein-protein ini beserta gen penyandinya telah menghambat elusidasi mekanisme molekuler dan menyisakan banyak pertanyaan terbuka mengenai fungsi biologis yang dimediasi oleh protein-protein tersebut. Di sini, saya meninjau karakteristik umum maupun unik dari protein PE dan PPE dari perspektif molekuler serta menghubungkan informasi ini dengan fungsinya dalam virulensi mikobakteri. Saya membahas bagaimana berbagai subkelompok (PE_PGRS, PPE-PPW, PPE-SVP, dan PPE-MPTR) didefinisikan dan mengapa klasifikasi ini sangat penting untuk memahami protein PE dan PPE baik secara individu maupun kelompok. Tujuan dari MicroReview ini adalah untuk merangkum dan menyusun informasi yang ada mengenai famili gen ini ke dalam kerangka berpikir yang disederhanakan terkait gen dan protein PE serta PPE. Dengan demikian, saya berharap dapat memberikan titik awal yang bermanfaat dalam mempelajari gen dan protein ini bagi para peneliti dengan berbagai latar belakang. Hal ini memiliki implikasi khusus bagi perancangan dan pemantauan kandidat vaksin baru serta pemahaman mengenai evolusi kompleks *M. tuberculosis*.
С момента своего открытия белки PE и PPE *Mycobacterium tuberculosis* вызывают неизменный исследовательский интерес. Названные по консервативным остаткам пролина (P) и глутаминовой кислоты (E) в их N-концевых доменах, эти белки, как предполагается, выполняют широкий спектр функций, связанных с вирулентностью и иммуномодуляцией. Однако методические сложности изучения данных белков и кодирующих их генов затрудняют выяснение молекулярных механизмов и оставляют множество открытых вопросов относительно опосредуемых ими биологических функций. В настоящем обзоре я рассматриваю общие и уникальные характеристики белков PE и PPE с молекулярной точки зрения, связывая эти данные с их ролью в вирулентности микобактерий. Я обсуждаю принципы выделения различных подгрупп (PE_PGRS, PPE-PPW, PPE-SVP и PPE-MPTR) и объясняю, почему данная классификация имеет первостепенное значение для понимания белков PE и PPE как по отдельности, так и в группах. Цель этого микрообзора — обобщить и структурировать имеющуюся информацию о данном семействе генов, сформировав упрощенную концептуальную основу для осмысления белков и генов PE и PPE. Тем самым я надеюсь предоставить исследователям различного профиля полезную отправную точку для изучения этих генов и белков. Это имеет особое значение для разработки и оценки новых кандидатных вакцин, а также для понимания эволюции комплекса *M. tuberculosis*.
*Mycobacterium tuberculosis*'in PE ve PPE proteinleri, keşiflerinden bu yana büyük bir ilgiyle incelenmektedir. N-terminal alanlarındaki korunmuş prolin (P) ve glutamik asit (E) kalıntılarından adını alan bu proteinlerin, virülans ve immün modülasyonda geniş kapsamlı roller üstlendiği öne sürülmektedir. Bununla birlikte, bu proteinlerin ve onları kodlayan genlerin incelenmesindeki teknik zorluklar, moleküler mekanizmaların aydınlatılmasını güçleştirmiş ve bu proteinlerin aracılık ettiği biyolojik işlevlere ilişkin yanıtlanmamış birçok soru bırakmıştır. Burada, PE ve PPE proteinlerinin ortak ve özgün özelliklerini moleküler bir bakış açısıyla gözden geçiriyor ve bu bilgileri mikobakteriyel virülanstaki işlevleriyle ilişkilendiriyorum. Farklı alt grupların (PE_PGRS, PPE-PPW, PPE-SVP ve PPE-MPTR) nasıl tanımlandığını ve PE ile PPE proteinlerini tekil olarak ve/veya gruplar halinde anlamak adına bu sınıflandırmanın neden son derece kritik bir öneme sahip olduğunu tartışıyorum. Bu MicroReview'ın amacı, söz konusu gen ailesine ilişkin mevcut bilgileri özetlemek ve PE ile PPE proteinleri ve genleri üzerine basitleştirilmiş bir düşünce çerçevesi halinde yapılandırmaktır. Böylelikle, farklı disiplinlerden gelen araştırmacılar için bu genlerin ve proteinlerin incelenmesinde faydalı başlangıç noktaları sunmayı umuyorum. Bunun, özellikle yeni aşı adaylarının tasarımı ve izlenmesi ile *M. tuberculosis* kompleksinin evriminin anlaşılması açısından önemli yansımaları bulunmaktadır.
Reference Key
ates2020newmolecular Use this key to autocite in the manuscript while using SciMatic Manuscript Manager or Thesis Manager
Authors Ates, Louis S;
Journal molecular microbiology
Year 2020
DOI
10.1111/mmi.14409
URL
Keywords
staphylococcus aureus Microbiology Pseudomonas aeruginosa cystic fibrosis infectious disease bacterial motility polymicrobial infections

Citations

No citations found. To add a citation, contact the admin at info@scimatic.org

Comments

No comments yet. Be the first to comment on this article.