Nonlinear association criterion, nonlinear Granger causality and related issues with applications to neuroimage studies.

Nichtlineares Assoziationskriterium, nichtlineare Granger-Kausalität und verwandte Fragestellungen mit Anwendungen auf Neuroimaging-Studien.

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2016
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Abstract
Quantifying associations in neuroscience (and many other scientific disciplines) is often challenged by high-dimensionality, nonlinearity and noisy observations. Many classic methods have either poor power or poor scalability on data sets of the same or different scales such as genetical, physiological and image data.Based on the framework of reproducing kernel Hilbert spaces we proposed a new nonlinear association criteria (NAC) with an efficient numerical algorithm and p-value approximation scheme. We also presented mathematical justification that links the proposed method to related methods such as kernel generalized variance, kernel canonical correlation analysis and Hilbert-Schmidt independence criteria. NAC allows the detection of association between arbitrary input domain as long as a characteristic kernel is defined. A MATLAB package was provided to facilitate applications.Extensive simulation examples and four real world neuroscience examples including functional MRI causality, Calcium imaging and imaging genetic studies on autism [Brain, 138(5):13821393 (2015)] and alcohol addiction [PNAS, 112(30):E4085-E4093 (2015)] are used to benchmark NAC. It demonstrates the superior performance over the existing procedures we tested and also yields biologically significant results for the real world examples.NAC beats its linear counterparts when nonlinearity is presented in the data. It also shows more robustness against different experimental setups compared with its nonlinear counterparts.In this work we presented a new and robust statistical approach NAC for measuring associations. It could serve as an interesting alternative to the existing methods for datasets where nonlinearity and other confounding factors are present.
Die Quantifizierung von Assoziationen in den Neurowissenschaften (sowie in vielen anderen wissenschaftlichen Disziplinen) wird häufig durch Hochdimensionalität, Nichtlinearität und verrauschte Beobachtungen erschwert. Viele klassische Methoden weisen entweder eine geringe statistische Teststärke oder eine schlechte Skalierbarkeit bei Datensätzen gleicher oder unterschiedlicher Skalen auf, wie beispielsweise bei genetischen, physiologischen und bildgebenden Daten. Basierend auf dem Rahmenwerk reproduzierender Kern-Hilbert-Räume schlagen wir ein neues nichtlineares Assoziationskriterium (NAC) mit einem effizienten numerischen Algorithmus und einem Schema zur p-Wert-Approximation vor. Zudem präsentieren wir eine mathematische Begründung, welche die vorgeschlagene Methode mit verwandten Verfahren wie der verallgemeinerten Kern-Varianz, der kanonischen Kern-Korrelationsanalyse und dem Hilbert-Schmidt-Unabhängigkeitskriterium verknüpft. NAC ermöglicht die Erkennung von Assoziationen zwischen beliebigen Eingabedomänen, solange ein charakteristischer Kern definiert ist. Ein MATLAB-Paket wurde bereitgestellt, um die Anwendung zu erleichtern. Umfangreiche Simulationsbeispiele und vier reale neurowissenschaftliche Anwendungsfälle – darunter Kausalitätsanalysen mittels funktioneller MRT, Calcium-Imaging sowie bildgebend-genetische Studien zu Autismus [Brain, 138(5):13821393 (2015)] und Alkoholabhängigkeit [PNAS, 112(30):E4085-E4093 (2015)] – dienen als Benchmark für NAC. Die Methode demonstriert eine überlegene Performanz gegenüber den getesteten bestehenden Verfahren und liefert zudem biologisch signifikante Ergebnisse für reale Datensätze. NAC übertrifft seine linearen Pendants, wenn Nichtlinearität in den Daten vorliegt, und weist im Vergleich zu nichtlinearen Alternativen eine höhere Robustheit gegenüber unterschiedlichen Versuchsaufbauten auf. In dieser Arbeit stellen wir mit NAC einen neuartigen und robusten statistischen Ansatz zur Quantifizierung von Assoziationen vor, der eine vielversprechende Alternative zu bestehenden Methoden für Datensätze darstellt, in denen Nichtlinearität und andere Störfaktoren vorliegen.
Reference Key
tao2016nonlinear Use this key to autocite in the manuscript while using SciMatic Manuscript Manager or Thesis Manager
Authors Tao, Chenyang;Feng, Jianfeng;
Journal journal of neuroscience methods
Year 2016
DOI
10.1016/j.jneumeth.2016.01.003
URL
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