multitype network-guided target controllability in phenotypically characterized osteosarcoma: role of tumor microenvironment

قابلية التحكم في الأهداف الموجّهة بشبكات متعددة الأنماط في الساركوما العظمية الموصوفة بالنمط الظاهري: دور البيئة المجهرية للورم

Clicks: 232
ID: 201616
2017
Free PDF
Article Quality & Performance Metrics
Overall Quality
Not rated
Combines reader engagement with the AI quality analysis. This article has not been analysed, so there is no overall score — reader engagement is measured and shown alongside.
AI Quality Assessment
Not analyzed
Readership in this journal
Steady

Ranked #565 of 644 articles by views in sudebno-meditsinskaia ekspertiza

Most read Least read

Bar heights use a square-root scale. Only the 120 most-read articles are drawn; the journal has 644 in total.

Mint this article as an NFT
Not yet minted

Create a permanent, verifiable on-chain record of this article on the Scimatic Network. The NFT is held in your Journament account, and you can withdraw it to your own wallet at any time.

5 SUSD one-off · no wallet required
Sign in to mint
Abstract
This study highlights the relevance of network-guided controllability analysis as a precision oncology tool. Target controllability through networks is potentially relevant to cancer research for the identification of therapeutic targets. With reference to a recent study on multiple phenotypes from 22 osteosarcoma (OS) cell lines characterized both in vitro and in vivo, we found that a variety of critical proteins in OS regulation circuits were in part phenotype specific and in part shared. To generalize our inference approach and match cancer phenotypic heterogeneity, we employed multitype networks and identified targets in correspondence with protein sub-complexes. Therefore, we established the relevance for diagnostic and therapeutic purposes of inspecting interactive targets, namely those enriched by significant connectivity patterns in protein sub-complexes. Emerging targets appeared with reference to the OS microenvironment, and relatively to small leucine-rich proteoglycan members and D-type cyclins, among other collagen, laminin, and keratin proteins. These described were evidences shared across all phenotypes; instead, specific evidences were provided by critical proteins including IGFBP7 and PDGFRA in the invasive phenotype, and FGFR3 and THBS1 in the colony forming phenotype.
تسلط هذه الدراسة الضوء على أهمية تحليل قابلية التحكم الموجَّه بالشبكات بوصفه أداة في طب الأورام الدقيق؛ إذ تكتسب قابلية التحكم في الأهداف عبر الشبكات أهمية واعدة في أبحاث السرطان لتحديد الأهداف العلاجية. وبالاستناد إلى دراسة حديثة أُجريت على أنماط ظاهرية متعددة من 22 خطاً خلوياً للساركوما العظمية (OS) جرى توصيفها مخبرياً (in vitro) وحيوياً (in vivo)، وجدنا أن مجموعة متنوعة من البروتينات الحيوية في دوائر تنظيم الساركوما العظمية كانت جزئياً نوعية لنمط ظاهري معين وجزئياً مشتركة. ولتعميم نهج الاستدلال المتبع لدينا ومواءمة التغايرية النمطية الظاهرية للسرطان، وظّفنا شبكات متعددة الأنواع وحددنا أهدافاً متوافقة مع المعقدات البروتينية الفرعية. وبناءً على ذلك، أثبتنا الجدوى التشخيصية والعلاجية لفحص الأهداف التفاعلية، وتحديداً تلك المُثراة بأنماط ترابط دالة ضمن المعقدات البروتينية الفرعية. كما برزت أهداف ناشئة ترتبط بالبيئة المجهرية للساركوما العظمية، وبأعضاء عائلة البروتيوغليكانات الصغيرة الغنية باللوسين وسيكلينات النمط D، إضافة إلى بروتينات الكولاجين واللامينين والكيراتين وغيرها. وتُعد هذه الشواهد الموصوفة سمات مشتركة عبر جميع الأنماط الظاهرية؛ في حين توفرت شواهد نوعية عبر بروتينات حيوية شملت IGFBP7 وPDGFRA في النمط الظاهري الغزوي، وFGFR3 وTHBS1 في النمط الظاهري المُشكِّل للمستعمرات.
Reference Key
sharma2017frontiersmultitype Use this key to autocite in the manuscript while using SciMatic Manuscript Manager or Thesis Manager
Authors Ankush Sharma, Caterina Cinti, Enrico Capobianco
Are you one of these authors? Claim your profile
Journal sudebno-meditsinskaia ekspertiza
Year 2017
DOI
10.3389/fimmu.2017.00918
URL
http://journal.frontiersin.org/article/10.3389/fimmu.2017.00918/full
Keywords
allergy

Citations

No citations found. To add a citation, contact the admin at info@scimatic.org

Comments

No comments yet. Be the first to comment on this article.