transcriptomic response of resistant (pi613981–malus sieversii) and susceptible (“royal gala”) genotypes of apple to blue mold (penicillium expansum) infection

الاستجابة الترانسكريبتومية للطرز الوراثية المقاوِمة (PI613981–Malus sieversii) والقابلة للإصابة ("رويال غالا") من التفاح لعدوى العفن الأزرق (Penicillium expansum)

Clicks: 281
ID: 198990
2017
Free PDF
Article Quality & Performance Metrics
Overall Quality
Not rated
Combines reader engagement with the AI quality analysis. This article has not been analysed, so there is no overall score — reader engagement is measured and shown alongside.
AI Quality Assessment
Not analyzed
Readership in this journal
Steady

Ranked #463 of 812 articles by views in phytochemistry letters

Most read Least read

Bar heights use a square-root scale. Only the 120 most-read articles are drawn; the journal has 812 in total.

Mint this article as an NFT
Not yet minted

Create a permanent, verifiable on-chain record of this article on the Scimatic Network. The NFT is held in your Journament account, and you can withdraw it to your own wallet at any time.

5 SUSD one-off · no wallet required
Sign in to mint
Abstract
Malus sieversii from Central Asia is a progenitor of the modern domesticated apple (Malus × domestica). Several accessions of M. sieversii are highly resistant to the postharvest pathogen Penicillium expansum. A previous study identified the qM–Pe3.1 QTL on LG3 for resistance to P. expansum in the mapping population GMAL4593, developed using the resistant accession, M. sieversii –PI613981, and the susceptible cultivar “Royal Gala” (RG) (M. domestica), as parents. The goal of the present study was to characterize the transcriptomic response of susceptible RG and resistant PI613981 apple fruit to wounding and inoculation with P. expansum using RNA–Seq. Transcriptomic analyses 0–48 h post inoculation suggest a higher basal level of resistance and a more rapid and intense defense response to wounding and wounding plus inoculation with P. expansum in M. sieversii –PI613981 than in RG. Functional analysis showed that ethylene–related genes and genes involved in “jasmonate” and “MYB–domain transcription factor family” were over–represented in the resistant genotype. It is suggested that the more rapid response in the resistant genotype (Malus sieversii–PI613981) plays a major role in the resistance response. At least twenty DEGs were mapped to the qM–Pe3.1 QTL (M × d v.1: 26,848,396–28,424,055) on LG3, and represent potential candidate genes responsible for the observed resistance QTL in M. sieversii–PI613981. RT–qPCR of several of these genes was used to validate the RNA–Seq data and to confirm their higher expression in MS0.
يُعد تفاح *Malus sieversii* من آسيا الوسطى سلفاً للتفاح المستأنس الحديث (*Malus × domestica*). وتُظهر عدة مدخلات وراثية من *M. sieversii* مقاومة عالية لممرض ما بعد الحصاد *Penicillium expansum*. وقد حددت دراسة سابقة موقع الصفة الكمية (QTL) المسمى qM–Pe3.1 على مجموعة الربط 3 (LG3) للمقاومة ضد *P. expansum* في مجتمع التعيين الخرائطي GMAL4593، والذي تم تطويره باستخدام المدخل الوراثي المقاوم *M. sieversii*–PI613981 والصنف الحساس "رويال جالا" (RG) (*M. domestica*) كأبوين. وكان الهدف من الدراسة الحالية هو توصيف الاستجابة الترانسكربتومية لثمار التفاح في الصنف الحساس RG والمدخل المقاوم PI613981 للجرح والعدوى بفطر *P. expansum* باستخدام تقنية تسلسل الحمض النووي الريبي (RNA-Seq). وتشير التحليلات الترانسكربتومية خلال الفترة من 0 إلى 48 ساعة بعد التلقيح إلى وجود مستوى أساسي أعلى من المقاومة، واستجابة دفاعية أسرع وأكثر شدة للجرح وللجرح المقترن بالعدوى بفطر *P. expansum* في *M. sieversii*–PI613981 مقارنةً بـ RG. كما أظهر التحليل الوظيفي زيادة تمثيل الجينات المرتبطة بالإيثيلين والجينات المشاركة في "الجاسمونات" و"عائلة عوامل النسخ ذات نطاق MYB" في الطراز الوراثي المقاوم. ويُرجح أن الاستجابة الأسرع في الطراز الوراثي المقاوم (*Malus sieversii*–PI613981) تلعب دوراً رئيساً في استجابة المقاومة. وعلاوة على ذلك، تم تعيين موقع ما لا يقل عن عشرين من الجينات متباينة التعبير (DEGs) ضمن موقع الصفة الكمية qM–Pe3.1 (M × d v.1: 26,848,396–28,424,055) على مجموعة الربط LG3، والتي تمثل جينات مرشحة محتملة مسؤولة عن موقع صفة المقاومة المرصود في *M. sieversii*–PI613981. وقد استُخدم تفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي بالنسخ العكسي (RT–qPCR) لعدة جينات من هذه المجموعة للتحقق من صحة بيانات RNA–Seq وتأكيد ارتفاع تعبيرها الجيني في MS0.
Reference Key
ballester2017frontierstranscriptomic Use this key to autocite in the manuscript while using SciMatic Manuscript Manager or Thesis Manager
Authors ;Ana-Rosa Ballester;John Norelli;Erik Burchard;Ahmed Abdelfattah;Elena Levin;Luis González-Candelas;Samir Droby;Michael Wisniewski
Journal phytochemistry letters
Year 2017
DOI
10.3389/fpls.2017.01981
URL
http://journal.frontiersin.org/article/10.3389/fpls.2017.01981/full
Keywords
wound healing malus domestica

Citations

No citations found. To add a citation, contact the admin at info@scimatic.org

Comments

No comments yet. Be the first to comment on this article.