dparsf: a matlab toolbox for pipeline data analysis of resting-state fmri

DPARSF: حزمة أدوات ماتلاب لمسار تحليل بيانات التصوير بالرنين المغناطيسي الوظيفي في حالة الراحة

Clicks: 374
ID: 190213
2010
Free PDF
Article Quality & Performance Metrics
Overall Quality
Not rated
Combines reader engagement with the AI quality analysis. This article has not been analysed, so there is no overall score — reader engagement is measured and shown alongside.
AI Quality Assessment
Not analyzed
Readership in this journal
Popular

Ranked #17 of 133 articles by views in Vacuum

Most read Least read

Bar heights use a square-root scale. Only the 120 most-read articles are drawn; the journal has 133 in total.

Mint this article as an NFT
Not yet minted

Create a permanent, verifiable on-chain record of this article on the Scimatic Network. The NFT is held in your Journament account, and you can withdraw it to your own wallet at any time.

5 SUSD one-off · no wallet required
Sign in to mint
Abstract
Resting-state functional magnetic resonance imaging (fMRI) has attracted more and more attention because of its effectiveness, simplicity and non-invasiveness in exploration of the intrinsic functional architecture of the human brain. However, user-friendly toolbox for pipeline data analysis of resting-state fMRI is still lacking. Based on some functions in Statistical Parametric Mapping (SPM) and Resting-State fMRI Data Analysis Toolkit (REST), we have developed a MATLAB toolbox called Data Processing Assistant for Resting-State fMRI (DPARSF) for pipeline data analysis of resting-state fMRI. After the user arranges the DICOM files and click a few buttons to set parameters, DPARSF will then give all the preprocessed (slice timing, realign, normalize, smooth) data and results for functional connectivity (FC), regional homogeneity (ReHo), amplitude of low-frequency fluctuation (ALFF), and fractional ALFF (fALFF). DPARSF can also create a report for excluding subjects with excessive head motion and generate a set of pictures for easily checking the effect of normalization. In addition, users can also use DPARSF to extract time courses from regions of interest.
حظي التصوير بالرنين المغناطيسي الوظيفي في حالة الراحة (fMRI) باهتمام متزايد نظراً لفعاليته وبساطته وطبيعته غير الباضعة في استكشاف البنية الوظيفية الذاتية لدماغ الإنسان. ومع ذلك، ما تزال هناك ندرة في حزم الأدوات سهلة الاستخدام المخصصة للتحليل المتسلسل لبيانات الرنين المغناطيسي الوظيفي في حالة الراحة. وبناءً على بعض الدوال في حزمة "التعيين البارامتري الإحصائي" (SPM) و"حزمة أدوات تحليل بيانات الرنين المغناطيسي الوظيفي في حالة الراحة" (REST)، طوّرنا حزمة أدوات برمجية في بيئة ماتلاب (MATLAB) تُدعى "مساعد معالجة البيانات للرنين المغناطيسي الوظيفي في حالة الراحة" (DPARSF) لإجراء التحليل المتسلسل للبيانات الخاصة بهذه التقنية. فبمجرد أن يُرتّب المستخدم ملفات "دايكوم" (DICOM) وينقر على بضعة أزرار لضبط المعلمات، يوفّر DPARSF جميع البيانات المُعالَجة مسبقاً (توقيت الشرائح، وإعادة المحاذاة، والتقييس المكاني، والتنعيم)، بالإضافة إلى نتائج الاتصالية الوظيفية (FC)، والتجانس الإقليمي (ReHo)، وسعة تذبذب الترددات المنخفضة (ALFF)، وسعة تذبذب الترددات المنخفضة الجزئية (fALFF). كما يمكن لبرنامج DPARSF إنشاء تقرير لاستبعاد الخاضعين للدراسة ذوي الحركة المفرطة للرأس، وتوليد مجموعة من الصور للتحقق بسهولة من أثر التقييس المكاني. فضلاً عن ذلك، يمكن للمستخدمين توظيف DPARSF لاستخراج المسارات الزمنية من المناطق محل الاهتمام.
Reference Key
yan2010frontiersdparsf: Use this key to autocite in the manuscript while using SciMatic Manuscript Manager or Thesis Manager
Authors ;Chaogan Yan;Yufeng Zang
Journal Vacuum
Year 2010
DOI
10.3389/fnsys.2010.00013
URL
http://journal.frontiersin.org/Journal/10.3389/fnsys.2010.00013/full
Keywords
data analysis resting-state fmri neuropsychiatry biological psychiatry rest

Citations

No citations found. To add a citation, contact the admin at info@scimatic.org

Comments

No comments yet. Be the first to comment on this article.