dissemination pattern of multidrug resistant carbapenemase producing klebsiella pneumoniae isolates using pulsed-field gel electrophoresis in southwestern iran

Clicks: 311
ID: 128340
2020
Free PDF
Article Quality & Performance Metrics
Overall Quality
Not rated
Combines reader engagement with the AI quality analysis. This article has not been analysed, so there is no overall score — reader engagement is measured and shown alongside.
AI Quality Assessment
Not analyzed
Readership in this journal
Emerging

Ranked #20 of 38 articles by views in clinical gastroenterology and hepatology : the official clinical practice journal of the american gastroenterological association

Most read Least read

Bar heights use a square-root scale.

Mint this article as an NFT
Not yet minted

Create a permanent, verifiable on-chain record of this article on the Scimatic Network. The NFT is held in your Journament account, and you can withdraw it to your own wallet at any time.

5 SUSD one-off · no wallet required
Sign in to mint
Abstract
Zahra Hashemizadeh,1 Zahra Hosseinzadeh,2 Negar Azimzadeh,3 Mohammad Motamedifar1,4 1Department of Bacteriology and Virology, Shiraz University of Medical Sciences, Shiraz, Iran; 2Basic Sciences in Infectious Diseases Research Center, Shiraz University of Medical Sciences, Shiraz, Iran; 3Department of Pathobiology, School of Veterinary Medicine, Shiraz University, Shiraz, Iran; 4Shiraz HIV/Aids Research Center, Institute of Health, Shiraz University of Medical Sciences, Shiraz, IranCorrespondence: Mohammad MotamedifarDepartment of Bacteriology and Virology, Shiraz University of Medical Science, Shiraz, IranTel/Fax +98 71 3230 4356Email motamedm@sums.ac.irBackground: Klebsiella pneumoniae is an important cause of healthcare-associated infection. Carbapenemases have increasingly been reported in Enterobacteriaceae, especially in K. pneumoniae.Propose: The objective of this study was to determine antibiotic resistance patterns, and the molecular epidemiology of multidrug resistant K. pneumoniae isolates, obtained from hospitalized patients in Shiraz, Iran.Methods: In this study, 60 K. pneumoniaeisolates were collected from Nemazee and Faghihi referral hospitals. Antibiotic susceptibility testing and MIC were performed by disk diffusion test and Epsilometer (E)-test strips, respectively. Carbapenemase genes were identified by polymerase chain reaction and sequencing. Then, clonal relationships were analyzed, using PFGE.Results: Thirty-three out of 60 K. pneumoniae isolates were resistant to carbapenems. Among the isolates, 86.6% were multidrug resistant (MDR). Polymyxin B (18.3%) and tigecycline (23.3%) were shown to be the most active agents against K. pneumoniae isolates. In our study, the high prevalence of blaNDM (45%) and blaOXA-48 (10%) was detected.Conclusion: The results of this study revealed the widespread carbapenemase gene between different wards in hospitals as a risk factor for treatment options. PFGE analysis showed 11 clusters and 3 singletons based on an 80% similarity level. Also, PFGE analysis showed that there were similar genetic patterns among K. pneumoniae isolates and these patterns were responsible for the distribution of infection in hospitals.Keywords: Klebsiella pneumoniae, pulsed-field gel electrophoresis, PFGE, carbapenemases
Zahra Hashemizadeh,1 Zahra Hosseinzadeh,2 Negar Azimzadeh,3 Mohammad Motamedifar1,4 1Bakteriyoloji ve Viroloji Anabilim Dalı, Şiraz Tıp Bilimleri Üniversitesi, Şiraz, İran; 2Enfeksiyon Hastalıklarında Temel Bilimler Araştırma Merkezi, Şiraz Tıp Bilimleri Üniversitesi, Şiraz, İran; 3Patobiyoloji Bölümü, Veteriner Fakültesi, Şiraz Üniversitesi, Şiraz, İran; 4Şiraz HIV/AIDS Araştırma Merkezi, Sağlık Enstitüsü, Şiraz Tıp Bilimleri Üniversitesi, Şiraz, İran Yazışma Adresi: Mohammad Motamedifar Bakteriyoloji ve Viroloji Anabilim Dalı, Şiraz Tıp Bilimleri Üniversitesi, Şiraz, İran Tel/Faks: +98 71 3230 4356 E-posta: motamedm@sums.ac.ir Giriş: Klebsiella pneumoniae, sağlık hizmeti ilişkili enfeksiyonların önemli bir nedenidir. Karbapenemazlar, Enterobacteriaceae ailesinde ve özellikle K. pneumoniae türünde giderek artan sıklıkta bildirilmektedir. Amaç: Bu çalışmanın amacı, Şiraz'da (İran) yatan hastalardan elde edilen çoklu ilaca dirençli K. pneumoniae izolatlarının antibiyotik direnç paternlerini ve moleküler epidemiyolojisini belirlemektir. Yöntemler: Bu çalışmada, Nemazee ve Faghihi sevk hastanelerinden 60 K. pneumoniae izolatı toplanmıştır. Antibiyotik duyarlılık testi ve MİK tayini sırasıyla disk difüzyon testi ve Epsilometre (E)-test şeritleri ile gerçekleştirilmiştir. Karbapenemaz genleri polimeraz zincir reaksiyonu ve dizileme yöntemleriyle tanımlanmıştır. Ardından, PFGE kullanılarak klonal ilişkiler analiz edilmiştir. Bulgular: Altmış K. pneumoniae izolatının 33'ü karbapenemlere dirençli bulunmuştur. İzolatların %86,6'sı çoklu ilaca dirençli (MDR) olarak belirlenmiştir. Polimiksin B (%18,3) ve tigesiklinin (%23,3), K. pneumoniae izolatlarına karşı en aktif ajanlar olduğu gösterilmiştir. Çalışmamızda, yüksek oranda blaNDM (%45) ve blaOXA-48 (%10) prevalansı tespit edilmiştir. Sonuç: Bu çalışmanın sonuçları, hastanelerdeki farklı servisler arasında karbapenemaz genlerinin yaygın bulunmasını tedavi seçenekleri açısından bir risk faktörü olarak ortaya koymuştur. PFGE analizi, %80 benzerlik düzeyine göre 11 küme ve 3 tekil patern göstermiştir. Ayrıca PFGE analizi, K. pneumoniae izolatları arasında benzer genetik paternlerin bulunduğunu ve bu paternlerin hastanelerdeki enfeksiyon yayılımından sorumlu olduğunu ortaya koymuştur. Anahtar Kelimeler: Klebsiella pneumoniae, puls alanlı jel elektroforezi, PFGE, karbapenemazlar
Reference Key
z2020infectiondissemination Use this key to autocite in the manuscript while using SciMatic Manuscript Manager or Thesis Manager
Authors ;Hashemizadeh Z;Hosseinzadeh Z;Azimzadeh N;Motamedifar M
Journal clinical gastroenterology and hepatology : the official clinical practice journal of the american gastroenterological association
Year 2020
DOI
DOI not found
URL
https://www.dovepress.com/dissemination-pattern-of-multidrug-resistant-carbapenemase-producing-k-peer-reviewed-article-IDR
Keywords Keywords not found

Citations

No citations found. To add a citation, contact the admin at info@scimatic.org

Comments

No comments yet. Be the first to comment on this article.