The phase problem.

معضلة الطور.

Clicks: 288
ID: 108637
2003
Article Quality & Performance Metrics
Overall Quality
Not rated
Combines reader engagement with the AI quality analysis. This article has not been analysed, so there is no overall score — reader engagement is measured and shown alongside.
AI Quality Assessment
Not analyzed
Readership in this journal
Star

Ranked #5 of 12 articles by views in acta crystallographica section d, biological crystallography

Most read Least read

Bar heights use a square-root scale.

Mint this article as an NFT
Not yet minted

Create a permanent, verifiable on-chain record of this article on the Scimatic Network. The NFT is held in your Journament account, and you can withdraw it to your own wallet at any time.

5 SUSD one-off · no wallet required
Sign in to mint
Abstract
Given recent advances in phasing methods, those new to protein crystallography may be forgiven for asking 'what problem?'. As many of those attending the CCP4 meeting come from a biological background, struggling with expression and crystallization, this introductory paper aims to introduce some of the basics that will hopefully make the subsequent papers penetrable. What is the 'phase' in crystallography? What is 'the problem'? How can we overcome the problem? The paper will emphasize that the phase values can only be discovered through some prior knowledge of the structure. The paper will canter through direct methods, isomorphous replacement, anomalous scattering and molecular replacement. As phasing is the most acronymic realm of crystallography, MR, SIR, SIRAS, MIR, MIRAS, MAD and SAD will be expanded and explained in part. Along the way, we will meet some of the heroes of protein crystallography such as Perutz, Kendrew, Crick, Rossmann and Blow who established many of the phasing methods in the UK. It is inevitable that some basic mathematics is encountered, but this will be done as gently as possible.
في ضوء التطورات الحديثة في طرائق تحديد الطَّوْر، قد يُعذر الوافدون الجدد إلى علم بلورات البروتين إذا تساءلوا: "أيّ مشكلة؟". وبما أن العديد من حضور اجتماع CCP4 ينتمون إلى خلفيات حيوية، ويواجهون صعوبات في التعبير البروتيني والبلورة، فإن هذه الورقة التمهيدية تهدف إلى استعراض بعض المبادئ الأساسية التي يُؤمل أن تجعل الأوراق البحثية اللاحقة ميسورة الفهم والاستيعاب. فما هو "الطَّوْر" في علم البلورات؟ وما هي "المشكلة"؟ وكيف يمكننا التغلب عليها؟ ستؤكد هذه الورقة على أن قِيَم الطَّوْر لا يمكن التوصل إليها إلا من خلال معرفة مسبقة ما بالبنية. كما ستمر الورقة سريعاً على الطرائق المباشرة، والإحلال متماثل التبلور، والتشتت الشاذ، والإحلال الجزيئي. ونظراً لأن تحديد الطَّوْر يمثل المجال الأكثر استخداماً للاختصارات في علم البلورات، فسيتم فك وتوضيح دلالات اختصارات: MR وSIR وSIRAS وMIR وMIRAS وMAD وSAD جزئياً. وخلال هذا المسار، سنتعرف على بعض روّاد علم بلورات البروتين أمثال: بيروتز (Perutz)، وكيندرو (Kendrew)، وكريك (Crick)، وروسمان (Rossmann)، وبلو (Blow)، الذين أرسوا دعائم العديد من طرائق تحديد الطَّوْر في المملكة المتحدة. ومما لا مناص منه التطرق إلى بعض المبادئ الرياضية الأساسية، غير أن ذلك سيتم بأبسط وأيسر شكل ممكن.
Reference Key
taylor2003theacta Use this key to autocite in the manuscript while using SciMatic Manuscript Manager or Thesis Manager
Authors Taylor, Garry;
Journal acta crystallographica section d, biological crystallography
Year 2003
DOI
DOI not found
URL URL not found
Keywords
active learning biochemistry laboratory discovery-driven enzyme purification inquiry based teaching integration of research into undergraduate teaching

Citations

No citations found. To add a citation, contact the admin at info@scimatic.org

Comments

No comments yet. Be the first to comment on this article.