Genetic Mapping Identifies Consistent Quantitative Trait Loci for Yield Traits of Rice under Greenhouse Drought Conditions.

التخريط الجيني يحدد مواقع صفات كمية متسقة لسمات محصول الأرز تحت ظروف الجفاف في البيوت المحمية.

Clicks: 534
ID: 85225
2020
Article Quality & Performance Metrics
Overall Quality
Not rated
Combines reader engagement with the AI quality analysis. This article has not been analysed, so there is no overall score — reader engagement is measured and shown alongside.
AI Quality Assessment
Not analyzed
Readership in this journal
Emerging

Ranked #3 of 80 articles by views in genes

Most read Least read

Bar heights use a square-root scale.

Mint this article as an NFT
Not yet minted

Create a permanent, verifiable on-chain record of this article on the Scimatic Network. The NFT is held in your Journament account, and you can withdraw it to your own wallet at any time.

5 SUSD one-off · no wallet required
Sign in to mint
Abstract
Improving drought resistance in crops is imperative under the prevailing erratic rainfall patterns. Drought affects the growth and yield of most modern rice varieties. Recent breeding efforts aim to incorporate drought resistance traits in rice varieties that can be suitable under alternative irrigation schemes, such as in a (semi)aerobic system, as row (furrow-irrigated) rice. The identification of quantitative trait loci (QTLs) controlling grain yield, the most important trait with high selection efficiency, can lead to the identification of markers to facilitate marker-assisted breeding of drought-resistant rice. Here, we report grain yield QTLs under greenhouse drought using an F population derived from Cocodrie (drought sensitive) × Nagina 22 (N22) (drought tolerant). Eight QTLs were identified for yield traits under drought. Grain yield QTL under drought on chromosome 1 (phenotypic variance explained (PVE) = 11.15%) co-localized with the only QTL for panicle number (PVE = 37.7%). The drought-tolerant parent N22 contributed the favorable alleles for all QTLs except and for grain number per panicle. Stress-responsive transcription factors, such as ethylene response factor, WD40 domain protein, zinc finger protein, and genes involved in lipid/sugar metabolism were linked to the QTLs, suggesting their possible role in drought tolerance mechanism of N22 in the background of Cocodrie, contributing to higher yield under drought.
يُعد تحسين مقاومة الجفاف في المحاصيل أمرًا بالغ الأهمية في ظل أنماط هطول الأمطار المتقلبة السائدة؛ إذ يؤثر الجفاف سلبًا على نمو وإنتاجية معظم أصناف الأرز الحديثة. وتهدف جهود التربية الحديثة إلى إدماج صفات مقاومة الجفاف في أصناف الأرز لتكون ملائمة لنظم الري البديلة، مثل النظم الهوائية (أو شبه الهوائية)، كالأرز المزروع في خطوط (المروي بالأثلام). ويمكن أن يؤدي تحديد مواقع الصفات الكمية (QTLs) المتحكمة في محصول الحبوب—وهي الصفة الأكثر أهمية ذات كفاءة الانتخاب العالية—إلى تحديد معلمات جزيئية تسهم في تسهيل التربية بمساعدة المعلمات الوراثية لاستنباط أرز مقاوم للجفاف. ونستعرض هنا مواقع صفات كمية لمحصول الحبوب تحت ظروف الجفاف في البيوت المحمية، باستخدام عشيرة F مشتقة من الهجين: كوكودري (Cocodrie) (الحساس للجفاف) × ناغينا 22 (N22) (المتحمل للجفاف). وقد حُددت ثمانية مواقع للصفات الكمية (QTLs) لصفات المحصول تحت ظروف الجفاف، حيث اشترك موقع صفة كمية لمحصول الحبوب تحت الجفاف الواقع على الكروموسوم 1 (التباين المظهري المُفسَّر (PVE) = 11.15%) في الموقع الجيني نفسه مع الموقع الوحيد المحدد لعدد النورات (PVE = 37.7%). وقد أسهم الأب المتحمل للجفاف (N22) بالأليلات المرغوبة لجميع مواقع الصفات الكمية باستثناء تلك المتعلقة بعدد الحبوب في النورة. كما ارتبطت بمواقع الصفات الكمية عواملُ نسخٍ مستجيبة للإجهاد، مثل عامل الاستجابة للإيثيلين، والبروتين ذي نطاق WD40، وبروتين إصبع الزنك، بالإضافة إلى جينات مشاركة في أيض الدهون/السكريات؛ مما يشير إلى دورها المحتمل في آلية تحمل الجفاف لدى N22 في الخلفية الوراثية للصنف كوكودري، مساهمةً بذلك في زيادة الإنتاجية تحت ظروف الجفاف.
Reference Key
baisakh2020geneticgenes Use this key to autocite in the manuscript while using SciMatic Manuscript Manager or Thesis Manager
Authors Baisakh, Niranjan;Yabes, Jonalyn;Gutierrez, Andres;Mangu, Venkata;Ma, Peiyong;Famoso, Adam;Pereira, Andy;
Journal genes
Year 2020
DOI
E62
URL
Keywords
grain yield drought rice greenhouse qtl panicle

Citations

No citations found. To add a citation, contact the admin at info@scimatic.org

Comments

No comments yet. Be the first to comment on this article.