Differential expression of six novel peroxidase cDNAs from cell cultures of sweetpotato in response to stress.

التعبير المتفاوت لستة أحماض نووية متممة (cDNA) جديدة لإنزيم البيروكسيداز من مزارع خلايا البطاطا الحلوة استجابةً للإجهاد.

Clicks: 360
ID: 83931
2003
Article Quality & Performance Metrics
Overall Quality
Not rated
Combines reader engagement with the AI quality analysis. This article has not been analysed, so there is no overall score — reader engagement is measured and shown alongside.
AI Quality Assessment
Not analyzed
Readership in this journal
Steady

Ranked #3 of 3 articles by views in molecular genetics and genomics : mgg

Most read Least read

Bar heights use a square-root scale.

Mint this article as an NFT
Not yet minted

Create a permanent, verifiable on-chain record of this article on the Scimatic Network. The NFT is held in your Journament account, and you can withdraw it to your own wallet at any time.

5 SUSD one-off · no wallet required
Abstract
Six peroxidase (POD) cDNAs were isolated from suspension cultures of sweetpotato (Ipomoea batatas) by cDNA library screening, and their expression was investigated with a view to understanding the physiological functions of each POD in relation to environmental stress. The gene products encoded by these cDNAs could be divided into two groups, anionic PODs (SWPA4, SWPA5, SWPA6) and basic PODs (SWPB1, SWPB2, SWPB3), on the basis of the predicted pI values of the mature proteins. RT-PCR analysis revealed that the six POD genes showed diverse expression patterns in various tissues of intact plants, a various stages of growth in suspension cultures, and in leaf tissues exposed to different stresses. The six genes from which they were derived are predominantly expressed in cultured cells of sweetpotato. Thus, transcripts of swpa4 were not detected in any tissues of the intact plant. The genes swpa6 and swpb1 were highly expressed in root tissues, whereas swpa6 and swpb3 were highly expressed in stem tissues. During suspension culture, the expression patterns of the six genes differed from each other. The level of swpa4, swpa5, swpb2 and swpb3 transcripts progressively increased during culture, whereas swpa6 and swpb1 showed high expression levels regardless of the age of the culture. In leaf tissues the six POD genes responded differently to various abiotic stresses. In particular, swpa4 was highly induced by several abiotic stresses, including exposure to hydrogen peroxide (440 mM) or NaCl (100 mM), and wounding of leaf tissues, suggesting that this POD gene is inducible by many stresses. Based on the different expression patterns of these POD genes, we propose that each POD may have different enzymatic properties and physiological functions during cell growth and development.
تم عزل ستة جزيئات من الدنا المتمم (cDNAs) لإنزيم البيروكسيداز (POD) من مزارع معلقة للبطاطا الحلوة (*Ipomoea batatas*) عن طريق فحص مكتبة الدنا المتمم، ودُرس تعبيرها الجيني بهدف فهم الوظائف الفسيولوجية لكل بيروكسيداز وعلاقته بالإجهاد البيئي. وأمكن تقسيم نواتج الجينات المشفرة بهذه الجزيئات إلى مجموعتين: البيروكسيدازات الأنيونية (SWPA4 وSWPA5 وSWPA6) والبيروكسيدازات القاعدية (SWPB1 وSWPB2 وSWPB3)، وذلك استناداً إلى قيم نقطة التعادل الكهربائي (pI) المتوقعة للبروتينات الناضجة. وكشف تحليل تفاعل البوليميراز المتسلسل بالنسخ العكسي (RT-PCR) أن جينات البيروكسيداز الستة أظهرت أنماط تعبير متباينة في مختلف أنسجة النباتات الكاملة، وفي مراحل النمو المختلفة في المزارع المعلقة، وكذلك في أنسجة الأوراق المعرضة لإجهادات متباينة. وتُعبَّر الجينات الستة المشتقة منها هذه النواتج بصورة رئيسية في الخلايا المزروعة للبطاطا الحلوة؛ إذ لم يتم الكشف عن نواتج نسخ الجين *swpa4* في أي من أنسجة النبات الكامل. كما أظهر الجينان *swpa6* و*swpb1* تعبيراً مرتفعاً في أنسجة الجذور، في حين أظهر *swpa6* و*swpb3* تعبيراً مرتفعاً في أنسجة السيقان. وخلال الزراعة المعلقة، اختلفت أنماط التعبير للجينات الستة عن بعضها البعض؛ حيث ارتفع مستوى نواتج نسخ الجينات *swpa4* و*swpa5* و*swpb2* و*swpb3* تدريجياً أثناء الزراعة، بينما أظهر الجينان *swpa6* و*swpb1* مستويات تعبير مرتفعة بغض النظر عن عمر المزرعة. وفي أنسجة الأوراق، استجابت جينات البيروكسيداز الستة بشكل متباين لمختلف الإجهادات اللاأحيائية؛ وعلى وجه الخصوص، تم حث الجين *swpa4* بدرجة عالية بفعل عدة إجهادات لاأحيائية، بما في ذلك التعرض لبيروكسيد الهيدروجين (440 ملي مولار) أو كلوريد الصوديوم (100 ملي مولار)، وجرح أنسجة الأوراق، مما يشير إلى أن جين البيروكسيداز هذا قابل للتحريض بالعديد من الإجهادات. وبناءً على أنماط التعبير المتباينة لجينات البيروكسيداز هذه، فإننا نقترح أن كل بيروكسيداز قد يمتلك خصائص إنزيمية ووظائف فسيولوجية مختلفة أثناء نمو الخلايا وتطورها.
Reference Key
park2003differentialmolecular Use this key to autocite in the manuscript while using SciMatic Manuscript Manager or Thesis Manager
Authors Park, S Y;Ryu, S H;Kwon, S Y;Lee, H S;Kim, J G;Kwak, S S;
Journal molecular genetics and genomics : mgg
Year 2003
DOI
DOI not found
URL URL not found
Keywords

Citations

No citations found. To add a citation, contact the admin at info@scimatic.org

No comments yet. Be the first to comment on this article.