In silico analysis of drought responsive transposons and transcription factors in Solanum tuberosum L.

Clicks: 319
ID: 5437
2019
Article Quality & Performance Metrics
Overall Quality
Not rated
Combines reader engagement with the AI quality analysis. This article has not been analysed, so there is no overall score — reader engagement is measured and shown alongside.
AI Quality Assessment
Not analyzed
Readership in this journal
Popular

Ranked #9 of 46 articles by views in harran tarım ve gıda bilimleri dergisi

Most read Least read

Bar heights use a square-root scale.

Mint this article as an NFT
Not yet minted

Create a permanent, verifiable on-chain record of this article on the Scimatic Network. The NFT is held in your Journament account, and you can withdraw it to your own wallet at any time.

5 SUSD one-off · no wallet required
Sign in to mint
Abstract
Patates ( Solanum tuberosum L.) tahıl grubundan olmayan önemli bir kültür bitkisidir ve küresel gıda güvenliği açısından büyük bir öneme sahiptir. Kuraklık, tarımsal üretimde büyük verim kayıplarına neden olan başlıca abiyotik stres faktörlerinden biridir ve patatesde yumru oluşumu, yumru verimi ve yumruların kalitesini olumsuz yönde etkilemektedir. Birçok ökaryotik türdeki genomun büyük bir bölümünü hareketli elementler oluşturmaktadır. Transpozon elementlerin (TE) stres altında nasıl aktive olduklarının moleküler mekanızması birçok çalışmada tanımlamıştır. Stres ve çevresel zorlukların, özellikle bitkilerde hareketli elementlerin ekspresyonunu veya transpozisyonunu uyardığı bilinmektedir. Strese tepki veren bu genlerin transkripsiyonu büyük ölçüde transkripsiyon faktörleri tarafından kontrol edilmektedir. Son yıllarda, bitkilerin kurağa tepkilerinin düzenlenmesinde önemli role sahip bazı transkripsiyon faktörleri belirlenmiştir. Bu çalışmada, transkripsiyon homolojisi ve anotasyon yaklaşımı kullanılarak yumru büyütme dönemindeki patateste kuraklığa tepki veren hareketli elementler ve transkripsiyon faktörü aileleri tanımlanmıştır. Sonuçlarımız, hareketli elementlerin alt aileleri için okuma sayılarının DNA ve RNA transpozonları arasında farklı dağılımlar sağladığını ve bHLH, WRKY, NAC, AP2/ERF transkripsiyon faktörlerini kodlayan çok sayıda genin, kuraklık stresine tepkinin düzenlenmesinde önemli işlevlere sahip olabileceğini göstermiştir. Strese tepkide yer alan hareketli elementlerin ve transkripsiyon faktörlerin tanımlanması ve bunların beraber değerlendirilmesi, işlevsel genomik çalışmaları ve strese dirençli bitkilerin geliştirilmesinde yeni ıslah stratejilerinin tasarlanması için yararlı bilgiler sağlayabilir.
Reference Key
ebru2019inharran Use this key to autocite in the manuscript while using SciMatic Manuscript Manager or Thesis Manager
Authors Ebru DERELLİ TÜFEKÇİ;Behcet İNAL and
Journal harran tarım ve gıda bilimleri dergisi
Year 2019
DOI
10.29050/harranziraat.439682
URL
Keywords Keywords not found

Citations

No citations found. To add a citation, contact the admin at info@scimatic.org

Comments

No comments yet. Be the first to comment on this article.