Microbial metagenomes and metatranscriptomes during a coastal phytoplankton bloom.

الميتاجينومات والميتاترانسكريبتومات الميكروبية أثناء ازدهار العوالق النباتية الساحلية.

Clicks: 347
ID: 4085
2019
Article Quality & Performance Metrics
Overall Quality
Not rated
Combines reader engagement with the AI quality analysis. This article has not been analysed, so there is no overall score — reader engagement is measured and shown alongside.
AI Quality Assessment
Not analyzed
Readership in this journal
Steady

Ranked #20 of 57 articles by views in scientific data

Most read Least read

Bar heights use a square-root scale.

Mint this article as an NFT
Not yet minted

Create a permanent, verifiable on-chain record of this article on the Scimatic Network. The NFT is held in your Journament account, and you can withdraw it to your own wallet at any time.

5 SUSD one-off · no wallet required
Sign in to mint
Abstract
Metagenomic and metatranscriptomic time-series data covering a 52-day period in the fall of 2016 provide an inventory of bacterial and archaeal community genes, transcripts, and taxonomy during an intense dinoflagellate bloom in Monterey Bay, CA, USA. The dataset comprises 84 metagenomes (0.8 terabases), 82 metatranscriptomes (1.1 terabases), and 88 16S rRNA amplicon libraries from samples collected on 41 dates. The dataset also includes 88 18S rRNA amplicon libraries, characterizing the taxonomy of the eukaryotic community during the bloom. Accompanying the sequence data are chemical and biological measurements associated with each sample. These datasets will facilitate studies of the structure and function of marine bacterial communities during episodic phytoplankton blooms.
توفّر بيانات السلاسل الزمنية الميتاجينومية والميتاترانسكريبتومية، التي تغطي فترة قدرها 52 يوماً في خريف عام 2016، حصراً شاملاً لجينات مجتمعات البكتيريا والعتائق، ونواسخها (transcripts)، وتصنيفها الحيوي أثناء حدوث ازدهار كثيف للسوطيات الدوارة في خليج مونتيري، كاليفورنيا، الولايات المتحدة الأمريكية. وتتألف مجموعة البيانات من 84 ميتاجينوماً (0.8 تيرا قاعدة)، و82 ميتاترانسكريبتوماً (1.1 تيرا قاعدة)، و88 مكتبة لمضخمات الرنا الريبوسومي 16S (16S rRNA amplicon libraries) مستخلصة من عينات جُمعت عبر 41 تاريخاً مختلفاً. كما تشتمل مجموعة البيانات أيضاً على 88 مكتبة لمضخمات الرنا الريبوسومي 18S (18S rRNA amplicon libraries)، تُميّز التصنيف الحيوي لمجتمع حقيقيات النوى أثناء فترة الازدهار. وتترافق مع بيانات التسلسل هذه قياسات كيميائية وبيولوجية مقترنة بكل عينة. ومن شأن مجموعات البيانات هذه أن تُسهّل دراسة بنية المجتمعات البكتيرية البحرية ووظائفها أثناء حالات الازدهار العارضة للعوالق النباتية.
Reference Key
nowinski2019microbialscientific Use this key to autocite in the manuscript while using SciMatic Manuscript Manager or Thesis Manager
Authors Brent Nowinski, Christa B Smith, Courtney M Thomas, Kaitlin Esson, Roman Marin, Christina M Preston, James M Birch, Christopher A Scholin, Marcel Huntemann, Alicia Clum, Brian Foster, Bryce Foster, Simon Roux, Krishnaveni Palaniappan, Neha Varghese, Supratim Mukherjee, T B K Reddy, Chris Daum, Alex Copeland, I-Min A Chen, Natalia N Ivanova, Nikos C Kyrpides, Tijana Glavina Del Rio, William B Whitman, Ronald P Kiene, Emiley A Eloe-Fadrosh, Mary Ann Moran
Are you one of these authors? Claim your profile
Journal scientific data
Year 2019
DOI
10.1038/s41597-019-0132-4
URL
Keywords Keywords not found

Citations

No citations found. To add a citation, contact the admin at info@scimatic.org

Comments

No comments yet. Be the first to comment on this article.