A step-by-step tutorial to use HierFstat to analyse populations hierarchically structured at multiple levels.

คู่มือการใช้งานทีละขั้นตอนสำหรับการใช้ HierFstat ในการวิเคราะห์ประชากรที่มีโครงสร้างเชิงลำดับชั้นหลายระดับ

Clicks: 421
ID: 3227
2007
Article Quality & Performance Metrics
Overall Quality
Not rated
Combines reader engagement with the AI quality analysis. This article has not been analysed, so there is no overall score — reader engagement is measured and shown alongside.
AI Quality Assessment
Not analyzed
Readership in this journal
Star

Ranked #9 of 61 articles by views in Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases

Most read Least read

Bar heights use a square-root scale.

Mint this article as an NFT
Not yet minted

Create a permanent, verifiable on-chain record of this article on the Scimatic Network. The NFT is held in your Journament account, and you can withdraw it to your own wallet at any time.

5 SUSD one-off · no wallet required
Sign in to mint
Abstract
The populations of parasites and infectious agents are most of the time structured in complex hierarchy that lies beyond the classical nested design described by Wright's F-statistics (F(IS), F(ST) and F(IT)). In this note we propose a user-friendly step-by-step notice for using recent software (HierFstat) that computes and test fixation indices for any hierarchical structure. We add some tricks and tips for some special data kind (haploid, single locus), some other procedure (bootstrap over loci) and how to handle crossed factors.
โดยส่วนใหญ่แล้ว ประชากรของปรสิตและเชื้อก่อโรคมักมีโครงสร้างเชิงลำดับชั้นที่ซับซ้อนเกินกว่ารูปแบบโครงสร้างแบบซ้อนใน (nested design) แบบดั้งเดิมที่อธิบายไว้ด้วยสถิติเอฟของไรต์ (Wright's F-statistics ได้แก่ F(IS), F(ST) และ F(IT)) ในรายงานเชิงวิชาการฉบับนี้ เรานำเสนอคู่มือการใช้งานทีละขั้นตอนที่ง่ายต่อผู้ใช้สำหรับซอฟต์แวร์รุ่นใหม่ (HierFstat) ซึ่งสามารถคำนวณและทดสอบดัชนีการตรึง (fixation indices) สำหรับโครงสร้างเชิงลำดับชั้นใด ๆ ได้ นอกจากนี้ เรายังได้เพิ่มเติมข้อแนะนำและเคล็ดลับสำหรับข้อมูลชนิดพิเศษบางประเภท (แฮพลอยด์, โลคัสเดี่ยว) กระบวนการอื่น ๆ (การบูตสแตรปข้ามโลคัส) ตลอดจนวิธีจัดการกับปัจจัยแบบไขว้ (crossed factors)
Reference Key
de-mees2007ainfection Use this key to autocite in the manuscript while using SciMatic Manuscript Manager or Thesis Manager
Authors de Meeûs, Thierry;Goudet, Jérôme;
Journal Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases
Year 2007
DOI
DOI not found
URL URL not found
Keywords Keywords not found

Citations

No citations found. To add a citation, contact the admin at info@scimatic.org

Comments

No comments yet. Be the first to comment on this article.