Identification of proteins that mediate the role of androgens in antler regeneration using label free proteomics in sika deer (Cervus nippon).

تحديد البروتينات التي تتوسط دور الأندروجينات في تجدد القرون باستخدام البروتيوميات الخالية من الواسمات لدى أيل السيكا (Cervus nippon).

Clicks: 403
ID: 27161
2019
Article Quality & Performance Metrics
Overall Quality
Not rated
Combines reader engagement with the AI quality analysis. This article has not been analysed, so there is no overall score — reader engagement is measured and shown alongside.
AI Quality Assessment
Not analyzed
Readership in this journal
Steady

Ranked #6 of 12 articles by views in general and comparative endocrinology

Most read Least read

Bar heights use a square-root scale.

Mint this article as an NFT
Not yet minted

Create a permanent, verifiable on-chain record of this article on the Scimatic Network. The NFT is held in your Journament account, and you can withdraw it to your own wallet at any time.

5 SUSD one-off · no wallet required
Sign in to mint
Abstract
Deer antlers offer a unique model to study organ regeneration in mammals. Antler regeneration relies on the pedicle periosteum (PP) cells and is triggered by a decrease in circulating testosterone (T). The molecular mechanism for antler regeneration is however, unclear. Label-free liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS/MS) was used to identify differentially-expressed proteins (DEPs) in the regeneration-potentiated PP (under low T environment) over the non-regeneration-potentiated PP (under high T environment). Out of total 273 DEPs, 189 were significantly up-regulated and 84 were down-regulated from these comparisons: after castration vs before castration, natural T vs before castration, and exogenous T vs before castration. We focused on the analysis only of those DEPs that were present in fully permissive environment to antler regeneration (low T). Nine transduction pathways were identified through the Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) database, including the estrogen signaling pathway. A total of 639 gene ontology terms were found to be significantly enriched in regeneration-potentiated PP (low T) from the DEPs. Reliability of the label free LC-MS/MS was determined by qRT-PCR to estimate the expression level of selected genes. The results suggest that up-regulated heat shock proteins (HSP90AB1, HSP90B1), peptidyl-prolyl cis-trans isomerase 4 (FKBP4), mitogen-activated protein kinase 3 (MAPK3) and calreticulin (CALR) and down-regulated SHC-transforming protein 1 (SHC1), heat shock protein family A member 1A (HSPA1A) and proto-oncogene tyrosine-protein kinase (SRC) may be associated directly or indirectly with antler regeneration. Further studies are required to investigate the roles of these proteins in regeneration using appropriate in vivo models.
تُمثّل قرون الأيائل نموذجًا فريدًا لدراسة تجدد الأعضاء لدى الثدييات. يعتمد تجدد القرون على خلايا سمحاق السويقة (PP)، ويُحفَّز بانخفاض هرمون التستوستيرون (T) في الدورة الدموية. ومع ذلك، لا تزال الآلية الجزيئية لتجدد القرون غير واضحة. استُخدم مطياف الكتلة المقترن بالكروماتوغرافيا السائلة الخالية من الوسوم (Label-free LC-MS/MS) لتحديد البروتينات متباينة التعبير (DEPs) في سمحاق السويقة المعزز لقدرة التجدد (في ظل بيئة منخفضة التستوستيرون) مقارنة بسمحاق السويقة غير المعزز لقدرة التجدد (في ظل بيئة مرتفعة التستوستيرون). ومن بين إجمالي 273 بروتينًا متباين التعبير، كان هناك 189 بروتينًا مرتفع التعبير بشكل ملحوظ و84 بروتينًا منخفض التعبير ناتجة عن المقارنات الآتية: بعد الإخصاء مقابل ما قبل الإخصاء، والتستوستيرون الطبيعي مقابل ما قبل الإخصاء، والتستوستيرون الخارجي مقابل ما قبل الإخصاء. وركّزنا في التحليل فقط على تلك البروتينات متباينة التعبير التي كانت موجودة في بيئة مواتية تمامًا لتجدد القرون (انخفاض التستوستيرون). وحُدِّدت تسعة مسارات لتوصيل الإشارة من خلال قاعدة بيانات موسوعة كيوتو للجينات والجينومات (KEGG)، بما في ذلك مسار إشارات الإستروجين. كما وُجد ما مجموعه 639 مصطلحًا من مصطلحات علم الوجود الجيني (Gene Ontology) مُثرًى بشكل ملحوظ في سمحاق السويقة المعزز للتجدد (انخفاض التستوستيرون) من واقع البروتينات متباينة التعبير. وتم التحقق من موثوقية تقنية LC-MS/MS الخالية من الوسوم عبر تقنية تفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي بالنسخ العكسي (qRT-PCR) لتقدير مستوى تعبير جينات مختارة. وتُشير النتائج إلى أن بروتينات الصدمة الحرارية المرتفعة التعبير (HSP90AB1 وHSP90B1)، وإيزوميراز ببتيديل-بروليل سيس-ترانس 4 (FKBP4)، والكيناز البروتيني المنشط بالميتوجين 3 (MAPK3)، والكالريتيكولين (CALR)، إلى جانب البروتينات منخفضة التعبير مثل البروتين 1 المحول لـ SHC (SHC1)، وعضو عائلة بروتين الصدمة الحرارية A رقم 1A (HSPA1A)، وتيروزين بروتين كيناز الجين الورمي الأولي (SRC)، قد ترتبط بصورة مباشرة أو غير مباشرة بتجدد القرون. وتتطلب هذه النتائج إجراء مزيد من الدراسات لاستقصاء أدوار هذه البروتينات في عملية التجدد باستخدام نماذج حية (in vivo) مناسبة.
Reference Key
akhtar2019identificationgeneral Use this key to autocite in the manuscript while using SciMatic Manuscript Manager or Thesis Manager
Authors Akhtar, Rana Waseem;Liu, Zhen;Wang, Datao;Ba, Hengxing;Shah, Syed Aftab Hussain;Li, Chunyi;
Journal general and comparative endocrinology
Year 2019
DOI
S0016-6480(19)30317-X
URL
Keywords Keywords not found

Citations

No citations found. To add a citation, contact the admin at info@scimatic.org

Comments

No comments yet. Be the first to comment on this article.