modeling the lps neutralization activity of anti-endotoxins

Clicks: 316
ID: 226117
2009
Free PDF
Article Quality & Performance Metrics
Overall Quality
Not rated
Combines reader engagement with the AI quality analysis. This article has not been analysed, so there is no overall score — reader engagement is measured and shown alongside.
AI Quality Assessment
Not analyzed
Readership in this journal
Popular

Ranked #415 of 1,185 articles by views in Journal of ethnopharmacology

Most read Least read

Bar heights use a square-root scale. Only the 120 most-read articles are drawn; the journal has 1,185 in total.

Mint this article as an NFT
Not yet minted

Create a permanent, verifiable on-chain record of this article on the Scimatic Network. The NFT is held in your Journament account, and you can withdraw it to your own wallet at any time.

5 SUSD one-off · no wallet required
Sign in to mint
Abstract
Bacterial lipopolysaccharides (LPS), also known as endotoxins, are major structural components of the outer membrane of Gram-negative bacteria that serve as a barrier and protective shield between them and their surrounding environment. LPS is considered to be a major virulence factor as it strongly stimulates the secretion of pro-inflammatory cytokines which mediate the host immune response and culminating in septic shock. Quantitative structure-activity relationship studies of the LPS neutralization activities of anti-endotoxins were performed using charge and quantum chemical descriptors. Artificial neural network implementing the back-propagation algorithm was selected for the multivariate analysis. The predicted activities from leave-one-out cross-validation were well correlated with the experimental values as observed from the correlation coefficient and root mean square error of 0.930 and 0.162, respectively. Similarly, the external testing set also yielded good predictivity with correlation coefficient and root mean square error of 0.983 and 0.130. The model holds great potential for the rational design of novel and robust compounds with enhanced neutralization activity.
تُعد عديدات السكاريد الشحمية البكتيرية (LPS)، والمعروفة أيضاً بالذيفانات الداخلية، مكونات بنيوية رئيسية في الغشاء الخارجي للبكتيريا سالبة الغرام، حيث تعمل كحاجز ودرع واقٍ بينها وبين البيئة المحيطة بها. ويُعتبر LPS عامل ضراوة رئيسياً؛ إذ يحفز بشدة إفراز السيتوكينات الموالية للالتهاب التي تتوسط الاستجابة المناعية للمضيف، وتتوج بحدوث صدمة إنتانية. أُجريت دراسات العلاقة الكمية بين البنية والنشاط لأنشطة إبطال مفعول LPS بواسطة مضادات الذيفانات الداخلية باستخدام واصفات شحنية وكيميائية كمومية. واختيرت شبكة عصبية اصطناعية تطبق خوارزمية الانتشار العكسي لإجراء التحليل متعدد المتغيرات. وقد ارتبطت الأنشطة المتوقعة الناتجة عن التحقق المتبادل بطريقة استبعاد عنصر واحد ارتباطاً وثيقاً بالقيم التجريبية، كما يتضح من معامل الارتباط والجذر التربيعي لمتوسط مربع الخطأ واللذين بلغا 0.930 و0.162 على التوالي. وبالمثل، أظهرت مجموعة الاختبار الخارجية أيضاً قدرة تنبؤية جيدة بمعامل ارتباط وجذر تربيعي لمتوسط مربع الخطأ بلغا 0.983 و0.130. ويمتلك هذا النموذج إمكانات واعدة للتصميم العقلاني لمركبات جديدة وقوية ذات قدرة معززة على إبطال المفعول.
Reference Key
prachayasittikul2009moleculesmodeling Use this key to autocite in the manuscript while using SciMatic Manuscript Manager or Thesis Manager
Authors ;Virapong Prachayasittikul;Thanakorn Naenna;Chartchalerm Isarankura-Na-Ayudhya;Chanin Nantasenamat;Tanawut Tantimongcolwat;Thummaruk Suksrichavalit;Chadinee Thippakorn
Journal Journal of ethnopharmacology
Year 2009
DOI
10.3390/molecules14051869
URL
http://www.mdpi.com/1420-3049/14/5/1869/
Keywords
artificial neural network endotoxin lipopolysaccharide anti-endotoxin

Citations

No citations found. To add a citation, contact the admin at info@scimatic.org

Comments

No comments yet. Be the first to comment on this article.