hippocampal transcriptomic profiles: subfield vulnerability to age and cognitive impairment

الملامح الترانسكريبتومية للحُصين: قابلية تأثر الحقول الفرعية بالتقدم في السن والقصور المعرفي

Clicks: 327
ID: 202658
2017
Free PDF
Article Quality & Performance Metrics
Overall Quality
Not rated
Combines reader engagement with the AI quality analysis. This article has not been analysed, so there is no overall score — reader engagement is measured and shown alongside.
AI Quality Assessment
Not analyzed
Readership in this journal
Steady

Ranked #111 of 234 articles by views in Frontiers in chemistry

Most read Least read

Bar heights use a square-root scale. Only the 120 most-read articles are drawn; the journal has 234 in total.

Mint this article as an NFT
Not yet minted

Create a permanent, verifiable on-chain record of this article on the Scimatic Network. The NFT is held in your Journament account, and you can withdraw it to your own wallet at any time.

5 SUSD one-off · no wallet required
Sign in to mint
Abstract
The current study employed next-generation RNA sequencing to examine gene expression differences related to brain aging, cognitive decline, and hippocampal subfields. Young and aged rats were trained on a spatial episodic memory task. Hippocampal regions CA1, CA3, and the dentate gyrus were isolated. Poly-A mRNA was examined using two different sequencing platforms, Illumina, and Ion Proton. The Illumina platform was used to generate seed lists of genes that were statistically differentially expressed across regions, ages, or in association with cognitive function. The gene lists were then retested using the data from the Ion Proton platform. The results indicate hippocampal subfield differences in gene expression and point to regional differences in vulnerability to aging. Aging was associated with increased expression of immune response-related genes, particularly in the dentate gyrus. For the memory task, impaired performance of aged animals was linked to the regulation of Ca2+ and synaptic function in region CA1. Finally, we provide a transcriptomic characterization of the three subfields regardless of age or cognitive status, highlighting and confirming a correspondence between cytoarchitectural boundaries and molecular profiling.
وظّفت الدراسة الحالية تقنية تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA) من الجيل التالي لفحص اختلافات التعبير الجيني المرتبطة بشيخوخة الدماغ، والتدهور المعرفي، والمناطق الفرعية للحصين. حيث تم تدريب جرذان يافعة ومسنة على أداء مهمة متعلقة بالذاكرة المكانية العرضية، ثم عُزلت مناطق الحصين CA1 وCA3 والتلفيف المسنن. وفُحص الحمض النووي الريبوزي الرسول متعدد الأدينيلات (Poly-A mRNA) باستخدام منصتي تسلسل مختلفتين، هما: "إلومينا" (Illumina) و"آيون بروتون" (Ion Proton). استُخدمت منصة إلومينا لإنشاء قوائم جينية أولية أظهرت تعبيرًا تفاضليًا ذا دلالة إحصائية عبر المناطق أو الأعمار أو بالارتباط مع الوظيفة المعرفية، ثم أُعيد اختبار هذه القوائم الجينية باستخدام البيانات المستمدة من منصة آيون بروتون. تشير النتائج إلى وجود اختلافات في التعبير الجيني بين المناطق الفرعية للحصين، وتدل على تباينات مناطقية في مدى التأثر بالشيخوخة؛ إذ ارتبط التقدم في العمر بزيادة التعبير عن الجينات المتعلقة بالاستجابة المناعية، لا سيما في التلفيف المسنن. وفيما يخص مهمة الذاكرة، ارتبط ضعف أداء الحيوانات المسنة بتنظيم الكالسيوم (+Ca2) والوظيفة المشبكية في المنطقة CA1. وأخيرًا، نقدّم توصيفًا ترانسكربتوميًا (نسخيًا) للمناطق الفرعية الثلاث بغض النظر عن العمر أو الحالة المعرفية، مما يبرز ويؤكد وجود توافق بين حدود البنية الخلوية والتنميط الجزيئي.
Reference Key
ianov2017frontiershippocampal Use this key to autocite in the manuscript while using SciMatic Manuscript Manager or Thesis Manager
Authors Lara Ianov, Matt De Both, Monica K. Chawla, Asha Rani, Andrew J. Kennedy, Ignazio Piras, Jeremy J. Day, Ashley Siniard, Ashok Kumar, J. David Sweatt, Carol A. Barnes, Matthew J. Huentelman, Thomas C. Foster
Are you one of these authors? Claim your profile
Journal Frontiers in chemistry
Year 2017
DOI
10.3389/fnagi.2017.00383
URL
http://journal.frontiersin.org/article/10.3389/fnagi.2017.00383/full
Keywords
gene expression cognitive function aging hippocampus transcription neuropsychiatry biological psychiatry

Citations

No citations found. To add a citation, contact the admin at info@scimatic.org

Comments

No comments yet. Be the first to comment on this article.