parv4 prevalence, phylogeny, immunology and coinfection with hiv, hbv and hcv in a multicentre african cohort [version 1; referees: 2 approved]

معدل انتشار فيروس بارفوفيروس 4 (PARV4)، وتطوره السلالي، وخصائصه المناعية، والعدوى المشتركة مع فيروس نقص المناعة البشرية (HIV)، وفيروس التهاب الكبد ب (HBV)، وفيروس التهاب الكبد ج (HCV) في أتراب أفريقية متعددة المراكز [الإصدار 1؛ المحكّمون: 2 معتمد]

Clicks: 367
ID: 151676
2017
Free PDF
Article Quality & Performance Metrics
Overall Quality
Not rated
Combines reader engagement with the AI quality analysis. This article has not been analysed, so there is no overall score — reader engagement is measured and shown alongside.
AI Quality Assessment
Not analyzed
Readership in this journal
Popular

Ranked #5 of 21 articles by views in ethnicity and disease

Most read Least read

Bar heights use a square-root scale.

Mint this article as an NFT
Not yet minted

Create a permanent, verifiable on-chain record of this article on the Scimatic Network. The NFT is held in your Journament account, and you can withdraw it to your own wallet at any time.

5 SUSD one-off · no wallet required
Sign in to mint
Abstract
Background: The seroprevalence of human parvovirus-4 (PARV4) varies considerably by region. In sub-Saharan Africa, seroprevalence is high in the general population, but little is known about the transmission routes or the prevalence of coinfection with blood-borne viruses, HBV, HCV and HIV. Methods: To further explore the characteristics of PARV4 in this setting, with a particular focus on the prevalence and significance of coinfection, we screened a cohort of 695 individuals recruited from Durban and Kimberley (South Africa) and Gaborone (Botswana) for PARV4 IgG and DNA, as well as documenting HIV, HBV and HCV status. Results: Within these cohorts, 69% of subjects were HIV-positive. We identified no cases of HCV by PCR, but 7.4% were positive for HBsAg. PARV4 IgG was positive in 42%; seroprevalence was higher in adults (69%) compared to children (21%) (p<0.0001) and in HIV-positive (52%) compared to HIV-negative individuals (24%) (p<0.0001), but there was no association with HBsAg status. We developed an on-line tool to allow visualization of coinfection data (https://purl.oclc.org/coinfection-viz). We identified five subjects who were PCR-positive for PARV4 genotype-3. Ex vivo CD8+ T cell responses spanned the entire PARV4 proteome and we propose a novel HLA-B*57:03-restricted epitope within the NS protein. Conclusions: This characterisation of PARV4 infection provides enhanced insights into the epidemiology of infection and co-infection in African cohorts, and provides the foundations for planning further focused studies to elucidate transmission pathways, immune responses, and the clinical significance of this organism.
**الخلفية:** يتباين معدل الانتشار المصلي لفيروس بارفوفيروس-4 البشري (PARV4) تبايناً كبيراً بحسب المنطقة الجغرافية. ففي أفريقيا جنوب الصحراء الكبرى، يرتفع معدل الانتشار المصلي بين عامة السكان، غير أن المعلومات المتاحة حول طرق الانتقال أو معدل انتشار العدوى المشتركة مع الفيروسات المنقولة بالدم؛ مثل فيروس التهاب الكبد B (HBV)، وفيروس التهاب الكبد C (HCV)، وفيروس نقص المناعة البشرية (HIV)، لا تزال محدودة. **المنهجية:** لاستكشاف خصائص فيروس PARV4 بمزيد من التعمق في هذه البيئة، مع التركيز بوجه خاص على معدل انتشار العدوى المشتركة وأهميتها السريرية، قمنا بفحص عينة أترابية تضم 695 فرداً جرى استقطابهم من ديربان وكيمبرلي (جنوب أفريقيا) وغابورون (بوتسوانا) للكشف عن أضداد IgG والحمض النووي (DNA) لفيروس PARV4، بالإضافة إلى توثيق حالة الإصابة بفيروسات HIV وHBV وHCV. **النتائج:** ضمن هذه المجموعات، كان 69% من الأفراد إيجابيين لفيروس HIV. ولم نرصد أي حالات إصابة بفيروس HCV عن طريق فحص تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR)، بينما كان 7.4% منهم إيجابيين للمستضد السطحي لالتهاب الكبد B (HBsAg). وسُجلت إيجابية أضداد IgG لفيروس PARV4 لدى 42% من العينة؛ حيث كان الانتشار المصلي أعلى لدى البالغين (69%) مقارنة بالأطفال (21%) (p<0.0001)، ولدى الأفراد الإيجابيين لفيروس HIV (52%) مقارنة بغير المصابين به (24%) (p<0.0001)، غير أنه لم يثبت وجود أي ارتباط بالحالة المصلية لـ HBsAg. وقمنا بتطوير أداة عبر الإنترنت لإتاحة التصور البياني لبيانات العدوى المشتركة (https://purl.oclc.org/coinfection-viz). كما حددنا خمسة أفراد كانت نتائج فحص PCR لديهم إيجابية للنمط الجيني 3 من فيروس PARV4. وغطت استجابات الخلايا التائية CD8+ خارج الجسم الحي (ex vivo) كامل بروتيوم فيروس PARV4، ونقترح وجود حاتمة جديدة مقيدة بـ HLA-B*57:03 داخل بروتين NS. **الاستنتاجات:** يقدم هذا التوصيف لعدوى فيروس PARV4 رؤى معمقة حول وبائيات العدوى والعدوى المشتركة في المجموعات الأترابية الأفريقية، كما يرسي الأسس اللازمة للتخطيط لدراسات مستقبلية موجهة تهدف إلى توضيح مسارات الانتقال، والاستجابات المناعية، والأهمية السريرية لهذا العامل الممرض.
Reference Key
sharp2017wellcomeparv4 Use this key to autocite in the manuscript while using SciMatic Manuscript Manager or Thesis Manager
Authors Colin P. Sharp, William F. Gregory, Louise Hattingh, Amna Malik, Emily Adland, Samantha Daniels, Anriette van Zyl, Jonathan M. Carlson, Susan Wareing, Anthony Ogwu, Roger Shapiro, Lynn Riddell, Fabian Chen, Thumbi Ndung'u, Philip J.R. Goulder, Paul Klenerman, Peter Simmonds, Pieter Jooste, Philippa C. Matthews
Are you one of these authors? Claim your profile
Journal ethnicity and disease
Year 2017
DOI
10.12688/wellcomeopenres.11135.1
URL
https://wellcomeopenresearch.org/articles/2-26/v1
Keywords
immune response

Citations

No citations found. To add a citation, contact the admin at info@scimatic.org

Comments

No comments yet. Be the first to comment on this article.